零-红蝶-故事架构:

　　建立在黄泉入口的皆神村，为了镇住在黄泉入口鸣动的“虚”，举行将“双子”当成“红贽”献出的仪式就是“红贽祭”。但是当镇住虚的力量减弱时，就必须再献出红贽，否则当虚的怨气爆发，将导致“大偿”发生(跟零的“祸刻”一样)令村子毁灭。而皆神村正好每隔一定的周期就会产下双子，而双子则被认为原本是一个人，但是却被分开产出，就是为了要当红贽祭中的红贽，因为村民相信在红贽祭中，由双子中的一人杀死另一人时，双子就会合而为一，并释放出强大的力量，这力量能够阵压住虚，也才能保护村子的平安，而代代担任红赞祭主祭神主的就是黑泽家。

　　最后一次成功的红赞祭是由桐生家的双子茜与蓟完成的，但是茜在杀了妹妹蓟后感到痛苦万分，于是身为人偶师的父亲为了弥补茜失去妹妹蓟的痛苦，因而为茜设计了双子人形。然而随着时间的过去，那个妹妹的人偶似乎真的被蓟的灵魂附身(事实上是被其他恶灵附身)，像这样被灵魂附身的人偶，人偶师称之为“躯”，传说躯会夺走他人的灵魂，因此是不被允许存在的。察觉有恶零附身在人偶身上时，身为人偶师的父亲决定要将躯丢进虚里，而害怕被毁灭的躯不断告诉茜不要再杀死她，对妹妹抱持着愧疚的茜，便带着躯的部分零件逃走，甚至最后在躯的控制下，茜终于杀死了自己的人偶师父亲。

　　平和的日子过去了，皆神村又要再一次举行红贽祭，这次是由立花家的双子睦月及树月举行仪式，他们是心地善良又感情深厚的两兄弟，但是当举行仪式时，由于树月无法亲自对睦月下手，所以睦月是由祭司杀死，虽然说睦月的确是在仪式中被杀死，并且也被丢进虚中，但是由于树月对睦月的思念太过强烈，使得红赞祭失败，虚并未被镇压住。实际上这种定期举行的红赞祭称为“阳祭”，而当阳祭失败时就必须举行“阴祭”，用来暂时防止虚的怨气爆发，以赚取举行下次阳祭的时间，而阴祭的内容就是将做为祭品的人，举行“身削仪式”变成人柱般的“楔”，再丢入虚中。如果当阳祭与阴祭都失败时，便会发生大偿，也就是毁灭的时刻。因此村民为了补偿阳祭的失败，所以看上了当时来到村子做民俗调查的真璧清次郎以及他的助手宗方良藏，并选定真璧清次郎作为阴祭的祭品，也就是楔。为了不让真璧清次郎发现他们的意图，村民于是将树月关在藏的牢房里，避免他向真璧清次郎通风报信。然而当树月知道了下一次阳祭的主角将是黑泽家八重跟纱重姊妹时，便写信给儿时开始的友人宗方良藏，请他将两姊妹带离皆神村，因为树月曾与睦月约定“不要让同样的事再发生在另一对双子身上”，在确知宗方会帮忙与两姊妹逃走之后，树月以为已经完成了当初与睦月的约定，对于睦月的死一直无法释怀的他，在了无牵挂后于是便在藏里上吊自杀。然而，他却不知道，真正逃出村庄的只有宗方良藏与黑泽八重。

　　而立花家还有一个可爱的小妹妹立花千岁，这个可爱的红衣小女孩身体一直不好，每当家里有客人来时就常常躲到柜子里，然而当大偿时刻来到之时，她也是因为害怕而躲在柜子里，可是最后仍然躲不掉死亡的命运。另外，她对于哥哥树月被关在藏的牢房里，千岁把责任归咎于八重跟纱重姊妹，认为如果不是为了要帮她们逃跑，哥哥也就不会被关起来，因此当澪来到立花家时，她认为澪就是八重，所以对她展开袭击。

　　仍然蒙在鼓里的真璧清次郎，被以允许他看虚为由招待到黑泽家，接着就被抓起来关到牢里，然后就被当成阴祭的“贽”了。在阴祭中，被当成楔的生贽所受到的痛苦越大，就能变成越强的楔，于是真壁全身被切割，又被绳子吊着举行提高其痛苦的身削仪式，最后被丢入虚里，结果变成楔的真壁因此对村子充满着怨恨，因此在大偿之日和纱重一起出现，为了让村人嚐到他所受的痛苦而大肆展开虐杀。

　　由于立花兄弟的仪式失败，在举行阴祭后的隔年，就轮到黑泽家八重跟纱重姊妹成为下一次阳祭的双子女巫，然而八重为了纱重着想而不愿举行红贽祭，于是就在仪式当天带着纱重逃亡，再加上由于树月的帮忙，使得她们有机会逃出皆神村，可是在逃跑的过程中，身体较差又常依赖姊姊的纱重，不小心摔下了山坡，而被村人抓了回去，虽然她相信姊姊一定会回来救她，然而结果八重并没有出现，于是她心中开始产生了绝望，再加上回到村子后她看到树月的屍体而痛哭，认为都是因为自己逃走的错，所以树月才会死，因而终于断了活下去的念头，于是同意进行红赞祭。然而在缺少另一名双子女巫下，绝望的纱重被用连绳吊死丢入虚中，可是在仪式中杀死纱重的并不是身为双子的八重，因此即使纱重被丢进虚里，仍然无法阻止虚中的怨气爆发，这个错误的仪式导致虚大开，发生了大偿，于是纱重和真璧清次郎的灵魂，怀着怨恨随着大偿的时刻降临，把活下来的村人逐次虐杀，边看着村人死去边狂笑的少女，她的笑声据说连村外都能听见，在虐杀完所有的村人后，纱重在无人的村里静静地等着姊姊回来。

　　八重和纱重虽然顺利的逃出了皆神村，然而逃亡途中纱重滑落山谷，因而与八重失散．八重因担心着留下的纱重而决定要回去找她，可是却在山上迷失了方向，等到回到原处时村子却已经消失，不知该如何是好的八重就在村子入口处哭泣，此时因为先前真璧清次郎要他先回去而一度离开村子的宗方良藏，遵守着和树月的约定再次拜访村子，找到了正在哭泣的八重，由于受到树月的托付，于是宗方照顾着受到冲击而失忆的八重，在相处的期间两人结为连理，之后还生下了女儿宗方美琴，后来他们夫妻为了调查冰室家的秘密，结果死在冰室家中，美琴就被一代主角深红的曾祖父收养，后来与深红的祖父结婚生下深雪，深雪又生下了儿子真冬与女儿深红，成为一代“零”故事的主线家族之源。

　　被毁灭了的皆神村，由于虚的封印被完全解除，闇由虚里面溢出，人们一旦吸入了闇，会在其中见到黄泉，因而发狂至死，被闇包住的村子有着任谁也无法逃出的黑夜，村子从外面看起来就像是被雾包住的一片森林，然而一旦被引诱进去，就再也不会回来，因此被世人称为“从地图上消失的村子”。若干年后的一天，好几年没回来的天仓姐妹来到了许久未再来的森林中，由于灵感力较强遭遇又类似纱重的姐姐茧，受到了纱重的呼唤，因而被引诱至从地图上消失的村子中，而担心不已的妹妹澪也一路追了上去，至于这对姐妹最后能否逃出这村子中呢？就看各位的努力了......